第一，一定要让笛子拥有配套的笛套或者笛盒。一般在购买笛子时都会随附笛套或者笛盒，但是如果没有的话，自己也一定要另行购买，将笛子存放在笛套或者笛盒中。

第二，要准备一个笛子的内膛毛刷。因为笛子的内膛空间窄小，一旦沾染污垢，很难用其他东西清理，稍一不慎可能会破坏笛子内壁，使用长柄毛刷可以轻松清理笛子内壁沾染的污垢。

第三，笛子收起不用的时候一定要在干燥的地方摆放，最好是在附近放一些干燥剂或者活性炭之类的，防潮，或者利用防潮袋封装。

第四，冬季和夏季存放笛子的时候要格外注意，因为大部分笛子都是竹制，所以在遇到高热低温的时候容易开裂，所以夏季要存放在阴凉干燥处，冬季要存放在温暖干燥处，并且避免笛子所处环境温度骤变。

第五，吹奏完毕想要收起笛子的时候，一定要先甩一甩，把先前吹进笛管内壁的口水甩出来，如果打算长时间储存的话，最好在两边中间系几根布条，防止开裂。

第六，笛子最好经常拿出来使用，定期给它清洗一次，水温不要太冷太热，温水偏热即可，可使用清洁剂等清洗，配合毛刷子刷内壁，但是切不可用洗衣粉或肥皂清洗，以免刺激性过大腐蚀竹壁。